基本信息

 

陈晓峰

副教授  硕士生导师

生物医学信息与基因组学研究中心

西安交通大学生命科学与技术学院

 

 

联系方式

Email:xiaofengch@xjtu.edu.cn

办公地点:中国西部科技创新港18号楼泓生楼,18-5082

 

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研究领域

研究方向:

绝大部分人类复杂疾病如肥胖和骨质疏松症等均具有高遗传力。因此,鉴定复杂疾病易感标记并解析其分子遗传学调控机制有助于为疾病发病机制解析和临床药物开发提供新靶点。然而,超过90%的疾病易感变异位于基因组非编码区(”junk DNA”),为解析其功能带来了严峻挑战。课题组结合生物信息学、功能基因组学、分子生物学等多学科基础方法,开展多组学整合方法和高通量调控元件测序方法开发研究,致力于系统解析疾病易感位点分子调控及致病机制,相关成果以一作/共同一作在Cell Genom、Am J Hum GenetBMC MedJCI InsightJ Invest DermatoJ Bone Miner Res 等国际遗传/医学权威期刊发表(均为1区Top),他引400余次,授权发明专利 2 项。欢迎对遗传学、生物信息学、分子生物学感兴趣的同学加入生物医学信息与基因组学研究中心(BIGC),课题组主页:https://gr.xjtu.edu.cn/web/yangtielinresearchgate主页:https://www.researchgate.net/profile/Tie-Lin-Yanggithub主页:https://github.com/xjtugenetics

 

代表性著作:

1. Chen XF#, Duan YY#, Jia YY#, Dong QH, Shi W, Zhang Y, Dong SS, Li M, Liu ZB, Chen F, Huang XT, Hao RH, Zhu DL, Jing RH, Guo Y*, Yang TL*. Integrative high-throughput enhancer surveying and functional verification divulges a YY2-condensed regulatory axis conferring risk for osteoporosis. Cell Genom. 2024 Mar 13;4(3):100501(Cell子刊)

2. Duan YY#, Chen XF#, Zhu RJ, Jia YY, Huang XT, Zhang M, Yang N, Dong SS, Zeng M, Feng Z, Zhu DL, Wu H, Jiang F, Shi W, Hu WX, Ke X, Chen H, Liu Y, Jing RH, Guo Y, Li M, Yang TL. High-throughput functional dissection of noncoding SNPs with biased allelic enhancer activity for insulin resistance-relevant phenotypes. Am J Hum Genet. 2023 Aug 3;110(8):1266-1288.IF=9.8, 生物一区Top

3. Yu K#, Chen XF#, Guo J, Wang S, Huang XT, Guo Y, Dong SS, Yang TL. Assessment of bidirectional relationships between brain imaging-derived phenotypes and stroke: a Mendelian randomization study. BMC Med. 2023 Jul 25;21(1):271.IF=9.3, 医学一区Top

​​​​4.Chen XF, Guo MR, Duan YY, Jiang F, Wu H, Dong SS, Zhou XR, Thynn HN, Liu CC, Zhang L, Guo Y*, Yang TL*. Multiomics dissection of molecular regulatory mechanisms underlying autoimmune-associated noncoding SNPs. JCI Insight.2020;5(17):e136477. IF: 8, 医学一区Top

5. Thynn HN#, Chen XF#, Hu WX, Duan YY, Zhu DL, Chen H, Wang NN, Chen HH, Rong Y, Lu BJ, Yang M, Jiang F, Dong SS, Guo Y, Yang TL*. An allele-specific functional SNP associated with two systemic autoimmune diseases modulates IRF5 expression by long-range chromatin loop formation. J Invest Dermato. 2020 Feb;140(2):348-360.e11.IF=6.5医学一区Top)

6.Chen XF#, Zhu DL#, Yang M, Hu WX, Duan YY, Lu BJ, Rong Y, Dong SS, Hao RH, Chen JB, Chen YX, Yao S, Thynn HN, Guo Y*, Yang TL*. An Osteoporosis Risk SNP at 1p36.12 Acts as an Allele-Specific Enhancer to Modulate LINC00339 Expression via Long-Range Loop Formation. Am J Hum Genet. 2018, 102(5):776-793.IF=9.8, 生物一区Top

7. Zhu DL#, Chen XF#, Hu WX, Dong SS, Lu BJ, Rong Y, Chen YX, Chen H, Thynn HN, Wang NN, Guo Y, Yang TL. Multiple functional variants at the 13q14 risk locus for osteoporosis regulate RANKL expression through long-range super-enhancer. J Bone Miner Res, 2018, 33(7):1335-1346.IF=6.2, 医学一区Top

 

教育背景和工作经历:

2024-至今      西安交通大学生命科学与技术学院 副教授 硕士生导师  

2020-2024      西安交通大学生命科学与技术学院 助理教授 

2014-2020      西安交通大学生命科学与技术学院 生物学 理学博士

2010-2014  西安交通大学生命科学与技术学院 生物工程 工学学士

 

获奖情况:

2022      陕西省优秀博士论文

2022      陕西高等学校科学技术研究优秀成果奖-特等奖

2020      西安交通大学青年优秀人才支持计划-A