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  • 教师姓名: 王运浩
  • 职称: 教授
  • 博士生导师: 是
  • 硕士生导师: 是
  • 学位: 理学博士学位
  • 所在单位: 第一附属医院
  • 电子邮箱:
  • 办公地点: 西安交通大学创新港校区21号楼Med-X研究院
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课题组iMeta文章上线-长读长测序解析转录组复杂性

发布时间:2026-10-04
点击次数:
发布时间:
2026-10-04
文章标题:
课题组iMeta文章上线-长读长测序解析转录组复杂性
摘要:
西安交通大学王运浩教授课题组与武汉大学王定杰教授课题组合作发表的文章-长读长测序解析转录组复杂性正式上线于iMeta杂志(IF=44.4)
内容:

转录组研究正从基因表达定量迈向转录本异构体层面的精细解析,以深入揭示可变剪接、转录本结构变异及重复序列来源的转录活动。然而,短读长测序在准确重建全长转录本、解析转座元件等复杂重复区域方面仍存在固有局限。以 PacBio和 ONT为代表的长读长测序技术,可获取全长或接近全长的转录本序列,为突破上述瓶颈提供重要途径。但较高的建库要求、数据噪声及快速迭代的数据处理方法,仍增加了实际应用的难度,研究者也缺乏贯通实验与分析全流程的系统性指南。针对这一需求,本综述以实践应用为导向,提供简明、贯通实验与分析的长读长转录组研究路线图,系统梳理平台与建库策略选择、核心计算处理及下游结果解读中的关键决策,并总结前沿进展与最佳实践建议。通过整合可复用的流程框架与操作清单,本综述将技术原理、方法选择与研究实践相衔接,为研究者规范、可重复地开展高分辨率的转录本异构体研究提供系统指导。

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本综述工作由本实验室与武汉大学王定杰教授合作完成,实验室2023级本科生尹晨熙、李珂莹为共同第一作者,2026级硕士生王甜、博士后韩怡来博士参与了该项研究。