Research Fields

  西安交通大学信息与生物医学交叉研究中心前身为叶凯青年科学家工作室。工作室成立于20163月,并于201642日正式挂牌,是学校首个以科学家名字命名的青年科学家工作室。交叉中心聚焦人工智能赋能生命科学研究,构建了集电信学部和Med-X数字医学研究所现有的超算平台、西安交通大学第一附属医院单细胞测序平台,以及涉及机器学习、人工智能、分子生物学、细胞生物学、病理学、药学的跨学科科研交叉平台。逐步建成一支具有国际一流水平的研究及成果转化团队,承担国家重大、重点课题及重大国际合作课题,不断产出重要原创性成果,培养一批具有国际竞争力的优秀学者,探索有利于科研创新的新体制,对相关学科及科研基地的发展形成有力支撑。

 

主要研究方向:

    1. AI for genomics: 人工智能赋能基因组学研究

    (1) 基于卷积神经网络(CNN)的复杂结构变异解析

                       ·               

 

    (2) 基于Transformer框架的从头基因注释与功能解析

                                        

 

    2. 基于统计建模的基因组精细解析

    (1) 系统建模串联重复区域超突变特征,多应用场景下基因组微卫星不稳定性检测

                                       

    

    (2) 基于split-read建模的多场景、多类型结构变异检测

                                      

 

实验室硬件设施:

    1.存储和计算系统

  交叉中心已经建立了专业的B类机房(3大模块:主机房包括39个机柜;UPS电池间;配电室间),位于Med-X数字医学研究所内。机房内配备了可以存储、处理各种生物医学大数据的高性能计算集群,其中包括1584CPU核心数,1.85PB的海量存储,3台4TB的大内存计算节点,对于中心存储、分析生物医学大数据、进行组学数据挖掘及人工智能计算方法开发提供有利支撑。

    2.生物实验平台

  交叉中心具有完备的生物医学研究平台,包括西安交通大学第一附属医院的单细胞研究中心以及位于Med-X数字医学研究所和电信学部的实验中心。生物实验平台支撑植物学、微生物学、细胞生物学、分子生物学等课题研究,同时还包含10x Chromium单细胞样本处理仪、BioanalyzerQubit等能够完成第二代、第三代测序文库和单细胞测序文库构建的高端设备。交叉中心具有市级主管部门审批的BSL二级生物学实验室资质。

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