个人简介

 

  姓名:叶凯

  性别:男

  国籍:中国

  出生年月:1977 - 06

  现任职单位:西安交通大学

  现任专业技术职务:教授

联系方式

kaiye@xjtu.edu.cn

西安交通大学电信学部

自动化科学与工程学院

叶凯青年科学家工作室

办公地点:彭康楼

 

工作室团队秘书

海静

haijing@xjtu.edu.cn

                工作室微信公众号

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教育经历

1995-09~1999-06 武汉大学 本科

2000-09~2003-06 武汉大学 硕士

2004-01~2008-12 荷兰莱顿大学 博士

 

工作经历

2003-07~2003-12 武汉大学 助教

2008-07~2009-06 欧洲生物信息学研究所,英国(European Bioinformatics Institute 博士后

2009-07~2012-11 莱顿大学,荷兰(Leiden University 助理教授

2012-12~2016-02 圣路易斯华盛顿大学,美国(Washington University in St. Louis)助理教授

2016-02~至今 西安交通大学 教授,博士生导师,“叶凯青年科学家工作室”负责人

研究方向

叶凯教授本科和硕士分别毕业于武汉大学生命科学学院和药学院,博士(cum laude)毕业于荷兰莱顿大学(Leiden University);博士后阶段师从Rolf Apweiler教授,在欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)实现生物信息学研究对象从蛋白质序列到基因组的转变。其后,分别在荷兰莱顿大学医学中心(Leiden University Medical Center)和美国圣路易斯华盛顿大学基因组研究所(The Genome Institute at Washington University in St. Louis)任助理教授,开发了以Pindel、MSIsensor为代表的系列基因组变异检测方法,受邀参加千人基因组(The 1000 Genomes Project)、肿瘤基因组路线图计划(The Cancer Genome Atlas, TCGA)等多项国际基因组项目。2016年初,叶凯教授全职回国,在西安交通大学电信学部组建信息学与生命科学相结合的交叉学科团队,继续深入研究结构变异的检测、表征和功能。基因组结构变异是大片段序列的重新排列,包括缺失、插入、重复、倒位等。相比单核苷酸多态性(SNP),结构变异发生数量较少但功能影响更显著。现有数据表明,结构变异与丰富多彩的生物性状进化和严重疾病表型密切相关。高通量测序技术的快速发展,带来了基因组小尺度变异研究的飞跃。然而,由于结构变异高发位点序列重复度高,变异长度往往大于测序数据长度,传统计算方法难以确定结构变异的位点、大小、类型、基因型,这严重阻碍深入探究结构变异在生物性状进化和疾病发生中的作用。如何针对海量生物组学数据,建立更有效的计算方法和数学模型来检测和表征结构变异,是基因组信息学领域关注的关键问题。叶凯教授长期致力于建立结构变异的检测算法和数学表征模型,探索其形成机理、发生率、偏好位点等规律,理解它们与物种演化、人民健康和疾病的关系(下图)。叶凯教授以主要作者在Science、Nature、Nat Med、Nat Commun等期刊发表SCI论文27篇(平均IF>11,ESI高被引2篇),SCI他引超过2677次;以通讯/共同通讯作者发表SCI论文21篇,近五年15篇。