祝贺徐暾博士生论文在国内生物信息著名期刊GPB上线。该论文开发了LTR特征发现及分类方法LTR_Stream,用于对特定物种或近缘物种中的LTR-RTs进行亚系谱系聚类分析,其精度高于目前基于数据库的谱系水平聚类方法,揭示了高分辨率聚类能够揭示LTR-RTs与宿主基因组之间复杂的相互作用。
Tun Xu, Stephen J Bush, Yizhuo Che, Huanhuan Zhao, Tingjie Wang, Peng Jia, Songbo Wang, Peisen Sun, Pengyu Zhang, Shenghan Gao, Yu Xu, Chengyao Wang, Ningxin Dang, Yong E Zhang, Xiaofei Yang, Kai Ye, Deciphering Complex Interactions Between LTR Retrotransposons and Three Papaver Species Using LTR_Stream, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2025;, qzaf061, https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzaf061