基本信息

 

徐云刚 博士

 

基础医学院·细胞生物学与遗传学系  教授

转化医学研究院·遗传与发育研究所  副所长

 

英文主页:www.xu-bioinfo.com

个人简介

2014年10月博士毕业于哈尔滨工业大学生命科学与技术学院和计算机科学与技术学院,随后分别在美国Wake Forest School of Medicine, UT Health, University of Pennsylvania任职博士后、副教职和研究助理教授;2021年2月获得“青年拔尖人才支持计划A类”并加入西安交通大学任现职。研究领域为生物信息学与多组学,主要研究方向包括:基因转录调控、计算表观遗传学与空间基因组、单细胞组学、多组学整合分析与机器学习和统计遗传学。截至目前,主持国家自然科学基金面上项目1项;主持陕西省秦创原引用高层次创新创业人才项目1项;主持西安交通大学“青年拔尖人才支持计划A类”1项、医学“基础-临床”融合创新项目1项;核心参与国家自然科学基金面上项目4项、美国NIH R01基金4项;担任4个领域内学(协)会生物信息学相关专业委员会委员、10余个国际SCI期刊编辑和国际会议程序委员会委员。曾获得省级和厅级科学技术奖各1项,教育部国家奖学金1项;已在Genome Biology、AJHG、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics和Bioinformatics等生物信息学领域顶级SCI期刊发表论著20余篇,申请发明专利3项。

研究领域

研究领域: 生物信息学、计算生物学、机器学习

长期围绕基因转录调控,针对整合分析多种组学大数据和揭示生物发育及疾病发生机理的关键技术和科学问题,致力于开发和利用机器学习方法,并结合分子与细胞实验手段,研究细胞内分子(如基因、非编码RNA及多种表观遗传修饰等)在发育过程中的协同作用以及疾病发生过程中的异常调控机制。主要研究方向包括:

  1. 基因转录调控
  2. 计算表观遗传学与空间基因组
  3. 单细胞组学
  4. 多组学整合分析与机器学习

教育经历

  1. 2010.09-2014.10:博士,哈尔滨工业大学,计算机科学与技术学院(导师:郭茂祖 教授)
  2. 2007.09-2010.07:硕士,东北林业大学,生命科学与技术学院(导师:詹亚光 教授)
  3. 2003.09-2007.07:学士,东北林业大学,生命科学与技术学院(导师:詹亚光李淑娟 教授)

工作经历

1.  2021.02-现在:教授/博导,西安交通大学,基础医学院

    2023.04-现在:学科规划与建设办公室 副主任、党委政策研究室 副主任(挂职)

2.  2019.04-2021.01: Postdoctoral Fellow, University of Pennsylvania and Children’s Hospital of Philadelphia, 美国;(合作导师:Yi Xing,邢毅

3.     2018.09-2019.03: Assistant Professor, School of Biomedical Informatics, University of Texas Health Science Center at Houston (UT Health), 美国;(合作导师:Xiaobo Zhou,周小波

4.     2017.07-2018.08: Faculty Associate, School of Biomedical Informatics, University of Texas Health Science Center at Houston (UT Health), 美国;(合作导师:Xiaobo Zhou,周小波

5.     2015.04-2017.06: Research Fellow, School of Medicine (又名Wake Forest Baptist Medical Center, WFBMC), Wake Forest University, 美国;(合作导师:Xiaobo Zhou,周小波)

6.     2014.11-2015.03, 研究助理, 计算科学与技术学院,哈尔滨工业大学 (HIT), 中国;(合作导师:郭茂祖,(现)北京建筑大学电气与信息工程学院院长)

联系方式

邮箱:Yungang.Xu【at】xjtu.edu.cn

地址1:西安市 雁塔区 雁塔西路76号 西安交通大学医学部 病理楼306室

地址2:西安市 西咸新区 中国西部科技创新港 弘仁楼(21号楼)4016室

主页:www.xu-bioinfo.com