科研团队

医学生物信息学与多组学

 

 

团队教师

徐云刚 教授(XuLab PI)

刘薇

助理教授 

虚位以待

（Co-PI）

 

 

在读研究生

 

博士

         

郭琛 2021博    李如风 2022博 

 

硕士

          

 

姚宇飞 2021硕   李康 2021硕   强敏  2022硕

 

 

轮转本科生

 

李亚晨（规培2019）、郭中昊（基础2019）、张恩永（宗廉2019）、邵锦瑞（宗廉2019）、张栩瑞（规培2020）、徐翌森（宗廉2020）

科研项目

（一）主持科研项目

  1. 陕西省秦创原引用高层次创新创业人才项目，45万元，2022-11至2025-10
  2. 西安交通大学医学“基础-临床”融合创新项目（co-PI），20万元，2022-09至2024-08
  3. 国家自然科学基金-面上项目，64万，2022-01至2025-12
  4. 青年拔尖人才支持计划A类，200万，2021-02至2027-02

（二）参与科研项目

1.     Deep Learning the Splicing (Epi)genetic Code. National Institutes of Health (NIH) (2015-2019).  (撰写并参与);

2.     Integrative approach to studying lncRNA functions. National Institutes of Health (NIH) (2017-2022). (参与);

3.     A novel tool package for single-cell RNA sequencing analysis with graph theory and deep networks. National Institutes of Health (NIH) (2018-2022).  (撰写并参与);

4.     Multiscale resolution and deep network approach for deconvolving different cell types in bulk tumors using single-cell sequencing data (scDEC). National Institutes of Health (NIH) (2019-2023).  (撰写并参与);

5.     国家自然科学基金(NSFC)：miRNA-基因双层网络的构建与分析方法研究，（2016-2019），61571163；金额：70万；主要撰写人并署名参与，排名第3位。

6.     国家自然科学基金(NSFC)：功能基因网络的重构与交叠模块识别方法，(2013-2016). NO. 61271346；金额：86万；主要撰写人并署名参与，排名第4位；

7.     国家自然科学基金(NSFC)：蛋白质相互作用和基因功能关联的对称性预测方法研究，(2012-2015). NO. 61172098；金额：62万；主要撰写人并署名参与，排名第5位；

8.     国家自然科学基金(NSFC)：大豆RNA结构与进化分析的信息处理方法研究，(2010-2013). NO. 60932008；金额：190万；参与。

主要任职

专业学（协）会兼职

  1. 国际计算生物学协会（ISCB）会员
  2. 美国遗传学会（GSA）会员
  3. 美国癌症研究协会（AACR）会员
  4. 中国细胞生物学学会（CSCB）终身会员
  5. 中国生物工程学会（CSBT）终身会员（青年工作委员会委员、计算生物学与生物信息学专业委员会委员）
  6. 中国计算机学会（CCF）专业会员（生物信息学专业委员会委员）
  7. 中国人工智能学会（AAI）专业会员（生物信息学与人工生命委员会委员）
  8. 中国生物化学与分子生物学会（CSBMB）专业会员
  9. 中国抗癌协会（CACA）专业会员
  10. 中国自动化学会 (CAA)专业会员（智能健康与生物信息专委会委员）
  11. 中国生物信息学学会（筹）会员（表观遗传信息学专业委员会委员）