在研项目：

1. 2025-2029，基于序列到图像转换策略的基因组序列计算框架构建，国家自然科学基金委重点项目，负责人
2. 2022-2027，关键模式生物基因组精细研究及其示范应用，科技部重点研发专项，负责人
3. 2022-2026，国家杰出青年科学基金（生物信息学），国家自然科学基金委，负责人

结题项目：

1. 2021-2024，肿瘤微卫星不稳定计算方法及其应用，国家自然科学基金委面上项目，负责人
2. 2018-2020，精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发，国家重点研发计划，子课题负责人
3. 2017-2020，中国人群多组学参比数据库与分析系统建设，国家重点研发计划，项目骨干
4. 2017-2020，基因组复杂变异的检测算法和应用，国家自然科学基金委面上项目，负责人